臺東美術館現由臺東縣政府文化處視覺藝術科管理，配置科長及數名人員，辦理本館園區戶外裝置、館內設施維護、展覽、教育推廣、典藏、國際藝術競賽及相關美術業務。
視覺藝術科展廳用地於臺東美術館之外，也在臺東縣政府文化處藝文中心展廳進行展覽業務。
